广东三九脑科医院病理科成立于2016年，学科秉承“人无我有、人有我优、人优我精、人精我专”的建科理念，经过多年发展，已成为全国神经病理重要新生力量。科室全职在岗人员9人，高级职称1人，中级职称2人，另聘请广东省人民医院病理科李智教授和暨南大学附属第一医院蒋光愉教授作为客座教授引领学科发展。

我院病理科以神经肿瘤、难治性癫痫和神经内科疾病组织学和分子病理诊断为特色，科室日常神经病理年检查量达5000余例，现有检测平台包括罗氏全自动免疫组化检测平台（Ventana）、DAKO Link48免疫组化检测平台，罗氏cobas z480实时荧光定量PCR检测平台及蔡司Scope A1荧光原位杂交检测工作平台。目前开展各系统常规病理检查、术中冰冻切片病理检查、免疫组化染色、特殊染色、肌肉染色、原位杂交技术、荧光原位杂交技术及聚合酶链氏反应技术等，在神经系统疾病相关抗体和探针品项齐全，神经系统疾病病理诊断经验丰富，诊断水平位于全国前列。

学科最近3年承办的重要会议包括：第三届（中国站）国际神经病理及癫痫外科病理研讨会、第十七届全国神经病理读片交流会、中枢神经系统神经病理诊断系列讲堂（全国）、2021版WHO中枢神经系统肿瘤分类新增病种和亚型系列课程（全国）、全国中枢神经系统临床病理诊断实践线上系列研讨会（全国）以及广东省神经病理诊断规范化培训会等，为中南地区及广东省神经病理诊断规范化培训做了大量工作。

我院病理科同时为国家人类遗传资源共享服务平台单位、中国国家脑肿瘤注册登记研究平台成员单位的承建科室和广东省基层医院病理科规范化建设示范单位。